基于Rostlab/prot_bert微调的蛋白质-SMILES相互作用预测模型
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发布时间 : 5/1/2022
模型简介
该模型是基于prot_bert在蛋白质-SMILES相互作用数据集上微调的版本,主要用于预测蛋白质与小分子(SMILES)之间的结合特性。
模型特点
蛋白质序列理解
能够有效理解蛋白质序列特征和结构信息
SMILES编码处理
可以处理化学小分子的SMILES表示形式
微调优化
在BindingDB相关数据集上进行了针对性微调
模型能力
蛋白质序列特征提取
小分子-蛋白质相互作用预测
生物分子结合特性分析
使用案例
药物发现
虚拟筛选
预测候选药物分子与靶标蛋白的结合可能性
药物重定位
发现已有药物与新型靶标的潜在相互作用
生物化学研究
蛋白质-配体相互作用分析
研究蛋白质与各种小分子配体的结合特性
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